DESCRIPTION :
Dans ce poste, vous développerez et mettrez en œuvre des stratégies d'analyse pour répondre aux questions scientifiques posées par les équipes cliniques.
Vous appliquerez des méthodes de pointe aux données spatiales, single-cell, bulk RNA-seq, WGS et exome afin d'identifier les processus biologiques clés qui sous-tendent la variabilité des phénotypes tumoraux (réponse au traitement, progression, outcome…). Un aspect central de vos missions concernera l'analyse des données single-cell et transcriptomiques spatiales issues de nos essais cliniques et programmes d'atlas tumoraux. Vous utiliserez pour cela les technologies Visium, Xenium, Merscope et GeoMx, en combinant méthodes éprouvées et développement de nouvelles approches.
Vous exercerez les missions suivantes :
* Apporter une expertise en analyse de données pour aider les équipes cliniques et scientifiques à atteindre leurs objectifs de recherche;
* Développer et mettre en œuvre des stratégies d'analyse pour les données single-cell et spatiales en utilisant un large éventail de méthodes;
* Travailler en étroite collaboration avec les équipes cliniques et scientifiques pour interpréter les résultats et orienter les décisions de recherche;
* Concevoir des modes de présentation innovants et accessibles grâce aux outils modernes de reporting;
* Intégrer dans les workflows les méthodes validées au sein de l'équipe Cancer Discovery Bioinformatics;
* Contribuer à la robustesse et à la reproductibilité des analyses sur la plateforme intégrée du groupe;
* Participer à la conception expérimentale et analytique;
* Gérer de manière autonome l'ensemble du workflow d'analyse;
* Contribuer aux objectifs globaux du groupe Clinical Discovery Bioinformatics;
* Accompagner et former des collègues plus juniors;
* Se tenir informé·e des évolutions du domaine pour continuer à développer ses compétences;
* Participer aux réunions, séminaires et ateliers de Gustave Roussy;
* Publier les résultats lorsque pertinent.
Code d'emploi : Ingénieur en Bioinformatique (h/f)
Domaine professionnel actuel : Biologistes
Niveau de formation : Bac+8
Temps partiel / Temps plein : Plein temps
Type de contrat : Contrat à durée indéterminée (CDI)
Compétences : Analyse des Données, Big Data, Bio-Informatique, Linux, Python (Langage de Programmation), Conception et Développement de Logiciel, High Performance Computing, Technologies Web, Esprit d'Équipe, Motivation Personnelle, Recherche, Biologie, Sciences Biomedicales, Recherche Clinique, Conception d'Expériences, Mathématiques, Oncologie, Reproductibilité, Gestion des Ressources, Etudes et Statistiques, Science des Données, Écosystèmes, Publication / Edition, Organisation et Préparation des Réunions
Type d'annonceur : Employeur direct